一般不会有后遗症。肠镜检查过程中会使肠粘膜和肠道受到刺激，可能会有一周左右的腹部胀气和不适不良反应，大多数随着肠道逐渐的修复症状会逐渐缓解，并并不会留下后遗症，避免过分担心和焦虑，属于是正常的检查副作用。恢复期间可以用毛巾局部热敷，促进肠道蠕动和食物消化，能够缓解不适症状。