主要的区别是所用的药物不同，三联疗法一般是使用两种抗生素配合质子泵抑制剂来进行治疗的。四联疗法是在三联疗法的基础上再增加了一种药物，药物含量是比较高的。三联疗法和四联疗法，对于治疗幽门螺杆菌效果都比较好，在服用药物期间还要改善饮食来调理，适当的吃一些流质和半流质的食物。