小便发黑伴有了疼痛感，常见的为尿路感染，认为是与感染细菌，支原体有很大关系的，会出现了小便发黑，经常有尿频，尿急，尿痛，尿道部位不舒服，所以需要去医院做个详细检查，明确疾病类型。如果是有尿路感染，需要用抗生素药物治疗，需要用左氧氟沙星片，三金片治疗。如果是有支原体感染，需要用抗支原体药物治疗。