导致肾两边隐隐作痛的原因是比较多的，比如患有肾脏结石就会有这样的现象，除此之外，如果患有肾盂肾炎或者是有腰肌劳损以及腰椎间盘突出的情况都会出现这样的现象。建议去专业的医院做相关检查，这样才能够明确具体原因。明确诊断之后要积极在医生指导下进行治疗。平时要注意多休息，避免过于劳累，还要清淡饮食。