熬夜出现肾区疼痛的原因可能是长期久坐所引起的腰肌劳损，或者有部分患者因为熬夜出现肾虚的症状，也会出现腰酸背痛的感觉。另外小便特别黄的话，就证明了摄入的水分是不够的，体内血容量相对不足，会造成小便黄和有臭味。所以要建议你改掉熬夜的习惯和适当的补充水分摄入。一般这种情况都是可以恢复的。最后你要密切观察自己是否合并有尿频尿急的症状，如果有则提示泌尿系统感染。