在全麻下，肚皮上做一个3厘米长的切口。将内窥镜从切口处直接插入肾盂内，先找到肾结石部位，将比较大的肾结石粉碎成小颗粒，再用取石器将小颗粒样的碎石一一取出。再对肾盂进行清洗，再查探是否有其他的肾结石，再同样的方法处理，直到肾结石全部取尽。输尿管结石也是用同样的方式处理。