百会穴按压时疼痛多指神经引起的疼痛，比如常见的有三叉神经痛、血管神经痛等，如果患者得了感冒等疾病，也会导致按压百会穴时出现疼痛感。另外，如果患者近期的工作压力比较大，或者情绪波动过大，也会导致百会穴疼痛，同时还会伴有注意力不集中、脾气暴躁、心情烦躁、睡眠质量差等症状。