肝脏磁共振主要检查肝脏功能的健康情况，具体是平扫、增强磁共振和核磁共振胰胆管水成像这些。平扫磁共振是显示肝囊肿、肝内胆管结石、肝囊结石这类疾病，然而胰胆管水成像是能更加清晰地显示出肝胆管走行处是否存在胆管狭窄、扩张、结石或占位性病变这类问题，最好的强化核磁共振是可以进一步的用于诊断肝脏占位性病变的性质，特别是对原发性肝癌及转移性肝癌的诊断及鉴别诊断有特别作用。