区别是发病部位不同、临床症状不同。肾结石主要是在肾脏组织当中出现了结石症，可能会使患者出现小便频繁和腰部疼痛，并且还会伴有下腹部坠胀感和血尿，有的肾结石还会掉落到输尿管当中，引起腹部剧烈的疼痛。胆结石多数是在胆囊当中形成的结石，会使患者出现上腹部疼痛和恶心呕吐、食欲不振等症状。