低位单纯性肛瘘和高位复杂性肛瘘均可治愈。低位单纯肛瘘手术相对简单，可一次根除。如果是复杂的肛瘘，可能需要在不同阶段进行多次手术以根除肛瘘。而在复杂肛瘘手术前，要进行全面检查，尤其是会阴MRI，明确内口及肛瘘窦的方向和方向，为手术做准备。术中应仔细辨认瘘管的方向，内口不能漏。因为肛瘘手术的关键是要确定内口的位置，否则很容易复发。