一般不会穿破肠子。无痛肠镜通常就是在做肠镜检查前注射麻醉药物，从而可以在麻醉的状态下进行肠镜检查，而且在检查的过程中并不会感觉到疼痛。在做完无痛肠镜检查后，还需要让专科医生查看检查结果，如果发现患有某些肠道疾病，应及时配合医生进行治疗，在治疗期间也要注意饮食卫生，另外要保证三餐定时定量。