肛门镜检查一般不会很疼痛。普通的肛门镜器械就是对肛门直肠的检查发现疾病进行初步诊断，所以没有必要担心。目前最先进的是用电子肛门镜，将检查和治疗等溶于一体，可以有效的发现肛门的痔疮、息肉、直肠等病变。如果是病情的需要，可以在医生的指导下检查。有稍微的不适，但可以忍受。