肛门囊肿多为肛门腺处的细菌感染或者开口处被堵塞而导致形成的，一般不会自行消失。治疗上需要采取手术切除。对于细菌感染引起者，容易形成肛周脓肿，会有明显的疼痛感以及发热、寒战等全身性的表现，初期症状不明显时，可以采取消炎药抗感染治疗。形成较大的脓肿，保守治疗无效者，建议手术切开引流。