大便真菌一般是不会自愈的，到医院进行大便常规检查的时候，如果发现大便当中出现了很多的中间说明身体受到了真菌感染，是需要通过使用一些抗菌的药物来进行治疗，这样能有能够有效的防止患者的肠道出现一些病变的现象。在平时生活中应该注意肛门部位的清洁和卫生，选择一些清淡和容易消化的食物。