常见的首先是感觉肛门有无狭窄、括约肌松弛和痉挛、肛裂、肛乳头肥大、增生，内痔较重，肛瘘感染内口、肛窦、瘘管通畅，同时直肠脱垂、黏膜松弛、内陷性脱垂，直肠下部病变、息肉，也可触及宫颈或前列腺，此外，可根据手指沾有血迹和粘液，如有肠道疾病。指检是肛肠医生最重要的检查手段，相当于肛肠医生的眼睛。