肛瘘手术痛苦不是特别大，在做手术的时候，一般都是在局部的麻醉之下通过手术治疗的，可能会导致轻微的疼痛，也属于一种比较常见的微创手术，创伤比较小，恢复比较快，在平时的时候一定要避免长时间久站久坐。做完手术之后，还要加强日常的护理，定时去医院换药。