高位肛瘘和低位肛瘘的区别表现为：1、肛瘘发生的具体位置不一样。高位肛瘘的瘘口一般在肛门括约肌之上，而低位肛瘘的路瘘口在肛门括约肌之下。2、治疗方法不同。高位肛瘘的治疗一般以相对保守的挂线疗法为主，而低位肛瘘可以直接切开治疗。3、预后不同。低位肛瘘的预后要比高位肛瘘好，发生大便失禁的几率不大。