可以在医生的指导下局部用药进行治疗，并且也可以采取手术的方法进行治疗，由于病情的严重程度不同，因此采取的治疗方法也是不相同的。肛周脓肿从屁眼里流脓多数是长期化脓感染所引发的肛瘘，可能会导致局部出现疼痛以及肿胀的情况，而且还有可能会引起排便困难，平时还要特别注意肛门部位的清洁卫生，并且要避免吃刺激性食物。