肛周脓肿伤口长好了，但是却发现里面有脓，这说明可能存在脓肿的局部破溃，需要尽快就医治疗。如果症状轻微，可以考虑保守治疗，在服用抗生素的同时，采用药浴治疗，促脓肿的消退。如果情况复杂，就要及早手术治疗，根据脓肿的具体情况，选择合适的治疗方案，可以采用脓肿穿刺引流术，及早治疗，尽快恢复。