手指凹陷的原因有可能长时间缺乏微量元素，导致手指凹陷。长时间泡热水导致钾钙软化引起凹陷。缺铁性贫血或者是全身性疾病导致手指凹陷。如恶性贫血、慢性手湿疹、扁平苔藓、牛皮癣等皮肤病，病程较长会导致指甲变形、凹陷或顶针一种状况。而且指甲营养不良、咬指甲成瘾也会使指甲出现凹陷和不平。