骨化三醇和阿法骨化醇的区别是，骨化三醇是活性较强的维生素D，可以促进身体对钙的吸收，同时还能减少钙的排泄。阿法骨化醇在体内产生作用较为缓慢，做还需经过肝脏转化后，才能转化为骨化三醇，对于需要长期用药的人没有耐受性，并且肝脏不好的人不能使用。而且骨化三醇容易在用药期间发生高钙血症，但阿法骨化醇则不易发生。