做完碎石治疗后腰还疼痛，要考虑是肾盂或者是输尿管黏膜受损造成的。泌尿系统结石在临床上比较多见，可以进行体外碎石治疗，在碎石治疗的过程中，有可能损伤肾盂和输尿管黏膜，患者手术后就会出现腰部疼痛不适的症状，一般情况下会持续5~7天的时间，可以使用抗生素预防感染。