射精后腰痛的原因是精囊炎。当精囊有炎症时，就可能会引起精索发炎并引起疼痛，而疼痛会扩散到腰部和腹部，从而引起腰部疼痛。可以通过精囊彩超声检查和其他检查来诊断，并及时进行抗感染治疗。当然，射精后腰痛也可能是因为前列腺炎，在性生活中，前列腺炎可能刺激腰部神经并引起腰痛。