跗骨窦综合征可以通过药物或者是封闭注射的方法来治疗，也可以配合理疗的方法来改善。需要在医生指导下通过口服消炎镇痛的药物来进行治疗，能够控制局部炎症感染引起的环境疼痛症状，也可通过注射封闭针的方法来改善疼痛，或者对局部进行热敷以及理疗。在治疗期间要选择卧床休息，尽量避免步行运动。