射精后腰疼是肾虚或者前列腺炎等因素造成的。由于很多男性患有这几种类型的疾病，所以患者射精之后，会有明显的腰疼。此时，患者可以到男科，做腰部影像学或者腰部彩超等方法进行检查。等到病情确诊之后，可以用护肾的药物，例如六味地黄丸或者金匮肾气丸等等方法来治疗缓解病情。