新冠全称为新型冠状病毒，新型冠状病毒感染有可能引起扁桃体发炎。新型冠状病毒感染的初期是上呼吸道感染，病毒复制后会侵入下呼吸道以及肺部，引起肺部感染，甚至出现胃肠道感染，以及血液、肝脏、心脏等其他部位的病毒侵入。在初始上呼吸道感染时，就包括鼻炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎和喉炎。扁桃体被病毒入侵后也会引起充血、水肿和发炎。新型冠状病毒感染后，扁桃体炎是其中的一个合并症，但是扁桃体发炎不是新型冠状病毒感染的患者一定会出现的状况，有时有、有时没有。