疼痛是脊柱结核主要的临床症状，也是脊柱结核患者就诊的主要原因。疼痛的程度依据病变的严重程度而定。病变轻微或病情早期痛感多不剧烈，类似于腰椎间盘突出的症状，休息后疼痛多可缓解。当病情进展或病变严重导致椎管受累或形成椎旁脓肿时痛感明显，休息后疼痛亦难缓解，部分患者疼痛剧烈须使用止痛药止痛。