盐酸氨基葡萄糖的副作用一般都比较轻微，绝大多数的个体服用以后没有明显的不良反应。但是，也有极个别的患者服用以后，有可能对胃肠道黏膜产生刺激作用，可能表现为腹泻、腹痛、恶心的症状。另外，也有一些个体可能会对这种成分发生过敏反应，出现起皮疹的表现。