甲氨蝶呤的副作用是导致恶心、呕吐、腹泻、口腔溃疡等。甲氨蝶呤是通过二氢叶酸还原酶来抑制肿瘤细胞生长与繁殖的，用于治疗急性白血病、乳腺癌、肺炎和颈部鳞癌等实体肿瘤，患者应在医生指导下用药，以免造成不良反应，类风湿关节炎和银屑病等免疫病患者要在医生指导下使用药物，该药物不能和乙醇一起使用，因为会对肝脏有损害，而且会增加肝脏的毒性。