碘甘油的危害较小，偶尔会引起皮肤过敏。本品主要是针对于治疗口腔黏膜溃疡和牙龈炎有较好的效果，患有牙周炎的患者使用本品也可以起到明显的作用，另外因为碘甘油的成分里边主要含有碘，患有甲抗的患者，要禁止服用碘甘油，会引起甲状腺的功能水平出现异常升高，严重的会导致心慌以及手抖。