中药六神曲具有健脾和胃，消食化积的功效。药物中含有酵母菌，挥发油，维生素等一些成分。在药理研究中证明它具有调节肠道菌群的作用。可以用来治疗脾胃虚弱，积食引起的腹胀，恶心呕吐等一些症状。此药还具有一定的降血脂作用，对于患有高血脂症的人群，就可使中药六神曲用来进行缓解。