复方木香小檗碱副作用主要包括消化系统方面，例如呕吐。孩子出现腹泻的原因比较多，如饮食不当或者饮食不洁、细菌感染肠道等。当家长发现孩子出现这些症状之后，可以通过化验大便或者钡餐等方法进行检查。确诊后，可以服用复方木香小檗碱进行治疗。患者服用药物后，药物会刺激胃粘膜引起呕吐等副反应。