麻仁丸常见的副作用有消化不良、肝功能受损、腹泻等症状，它是属于一种凉寒性的药物，有胃寒的人尽量不要食用麻仁丸会引起消化不良，脾胃虚寒的症状较重。麻仁丸有通肠润便的作用，对于经常便秘的人促进肠蠕动有一定的疗效，麻仁丸是需要肝脏进行代谢的，长期服用会对肝脏造成一定的损伤。