莲花清瘟胶囊属于中药成分类药物，临床研究副作用较小，主要副作用就是胃肠道反应，会有少量患者出现腹胀、腹泻、恶心、反酸等症状，建议胃肠不好的人饭后服用。但是不建议不遵医嘱服用，已经出现拉肚子的情况建议立即停药，遵医嘱食用缓解胃肠道的药物治疗拉肚子的情况。