济生肾气丸与金辉肾气丸的区别主要是药物的组成成分以及功能不同，济生肾气丸在温补肾阳的同时，还可以利水消肿，药物的成分包括熟地，黄山茱萸，牡丹皮等中药，主要是用来治疗肾虚水肿以及腰膝无力等，而金匮肾气丸的药物成分，包括牛膝，茯苓以及牡丹皮等，有治疗腰膝酸软以及畏寒肢冷的症状。