补中益气丸和附子理中丸所治疗的疾病不同。补中益气丸功效是调补脾、益气生阳、肝温去热，主要是治疗脾胃虚弱、体倦乏力、身热有汗、头痛恶寒、子宫脱垂等症状。而附子理中丸功效是止泻止痛、温脾散寒，用于治疗心绞痛、腹部疼痛、脾胃虚寒等症状，另外要注意使用该药物时忌吃生冷辛辣的食物。