氯氮平的最严重副作用就是会发生粒细胞缺乏症，甚至是继发性的感染。比较常见的副作用就是便秘和流口水，而且极少数的患者会出现胃痛，恶心，呕吐的不良反应，氯氮平在长期服用后会增加肝肾的负担，使肝肾功能发生异常，所以最好定期复查肝肾功能，在服用药物期间如果出现身体发热的症状，要立即停药。