葡萄糖酸氯己定一般不会有副作用。此药物对于口腔溃疡和咽峡炎有很好的治疗效果，其中的成分主要是葡萄糖酸氯已定，如果患有门齿填补的情况，就不能用此药来治疗，最好在服用此药的时候，不要接触到眼睛局部，以免引起不适感出现，该药物不能和碳酸氢盐一起配伍，会造成药物发生相互的作用。