复方阿莫西林和阿莫西林的主要区别是成分不同。复方阿莫西林是含有两种或者是两种以上成分的药物，阿莫西林只是单一的一种成分，阿莫西林稳定性差，长期暴露在空气中可能会出现吸潮降碱，有些患者服用之后可能还会出现过敏反应。复发阿莫西林穿透细胞壁能力比较强，能够很好的达到治疗的效果。