阿米卡星的副作用是可能会造成听神经的损伤严重的从而会出现不可逆的听力障碍。如果长期服用这种药物也可能会出现尿蛋白的情况，从而导致肾毒性，极少数的患者在服用药物后会出现过敏的症状，比如皮肤出现皮疹或者荨麻疹，如果在服用药物期间身体出现了异常，要及时到医院进行就医，以免对身体的健康造成影响。