泮托拉唑有些副作用，一些患者在服用此药后会出现头痛以及头晕的感觉，也有个别患者服药后会出恶心以及腹痛的感觉，还有些患者服药后会出现大便干结的症状，个别患者对此药过敏，皮肤上会长出皮疹。儿童患者必须在医嘱下服用此药，以免用药过量对身体造成影响，孕妇患者不能服用此药，以免对胎儿造成影响。