一只苦参凝胶大概需要2到3天的时间就可以排除干净。如果在治疗过程中药物使用过多，排除的时间可能会需要三天左右的时间，具体的时间需要根据患者使用药物的剂量来决定，苦参凝胶具有消炎杀菌的作用，主要是用于女性阴道炎的治疗，通常会随着患者身体的分泌物一块排出阴道。