长期或者是过量服用奥美拉唑都会产生一系列的副作用。常见的副作用有头晕头痛，恶心呕吐以及腹痛腹泻等。也有一部分人会出现睡眠紊乱，乏力以及感觉异常的现象。奥美拉唑能够起到一定程度的抑制胃酸分泌的效果，若是长期服用，还有可能会导致胃黏膜发生萎缩。