灭活疫苗与减毒疫苗最大的区别在于制作的方法是有所不同的，由于制作方法不同，所以两种疫苗最终的防护效果也会有所不同。此外，灭活疫苗与减毒疫苗还有一个比较明显的区别在于对某些疾病具有一定的针对性。从安全性方面来说，灭活疫苗的安全性相比减毒疫苗会更好一些，主要原因在于灭活疫苗不仅有着较高的稳定性，而且更容易保存。