长期服用水飞出现肠道的不适感，像会感蓟会有轻微的副作用。某些患者长期服用此药会觉到恶心呕吐以胸闷等，少数患者长期服用后，会出现过敏现象，皮肤可能长出皮疹。儿童和孕妇患者不要服用此药，以免对身体造成影响。在用药之前，患者要事先咨询医生，避免用药过量造成不良反应，从而加剧病情。