褪黑素片通常有副作用。长期服用可能会对药物产生依赖性，停药后会引起体内褪黑素不足的副作用。长期服用褪黑素片还可能会对性功能及性欲造成一定的影响，女性则可能会导致不孕的结果，因此应尽量避免长期服用。另外在服药时不能和阿司匹林药物同时服用，否则可能会引起药物反应。