酮康唑洗发水的副作用比较少，少数患者可能会出现刺激性或过敏，比如可能会出现皮肤灼热感，瘙痒，或皮炎。这些发生率都是比较低的，并且也是可以耐受的。还有极少数人会出现脱发，头发颜色改变等不良反应。酮康唑洗发水是不建议长期使用的，如果在使用期间头皮屑没有改善，需要停止可以使用，然后在医生的协助下换其他的药物进行治疗。