黄连羊肝丸的副作用是有可能会导致视力下降。药物的成分有黄连以及夜明砂等，最主要的功效就是泻火明目，如果长期服用药物，有可能会使药物在体内沉积，从而对视力造成影响，有的患者在服用后会有腹泻以及腹胀的情况发生，极少数的患者会有对药物成分过敏的现象，比如皮肤红疹以及瘙痒红肿。