克林霉素甲硝唑的副作用是会导致皮肤局部的干燥，有可能会对皮肤的局部造成刺激，出现过敏性的皮炎以及荨麻疹等红肿的现象，通常没有特别大的不良反应。在使用药物的时候不可以大面积的长期使用，可能会对皮肤造成伤害，在使用药物的时候千万要注意不要接触到眼睛，以免造成眼睛的粘膜损伤。