黄连素的副作用主要是可以导致身体出现胃酸过多的情况，同时如果经常地使用黄连素，很可能会造成恶心呕吐的症状，甚至会导致身体出现皮疹和发热。出现这些症状的时候，要及时的到医院进行就医，同时也要立即停止服用黄连素，可以在医生的指导下选择另外一种药物服用。并且在服药期间尽量不要喝茶，以免影响到药物的效果。